固定资产清理科目在处理中会有余额，处理后不会有余额。
因为固定资产清理是属于资产类科目，它是一个过渡科目，在全部的清理工作未完成之前，记录因为清理而发生的各项收入和损失，收入放贷方，损失放借方。最后用贷方合计减借方合计，正为盈利，负为损失。可以用分录来分情况理解：
1，出售、报废和毁损的固定资产转入清理时：
借：固定资产清理 （转入清理的固定资产帐面价值）
累计折旧 （已计提的折旧）
固定资产减值准备 （已计提的减值准备）
贷：固定资产 （固定资产的账面原价）
2，固定资产在发生清理费用时：
借：固定资产清理
贷：银行存款
3，计算交纳营业税时：
企业销售房屋、建筑物等不动产，按照税法的有关规定，应按其销售额计算交纳营业税。
借：固定资产清理
贷：应交税金——应交营业税
4，收回出售固定资产的价款、残料价值和变价收入等时：
借：银行存款
原材料
贷：固定资产清理
5，应由保险公司或过失人赔偿时：
借：其他应收款
贷：固定资产清理
6，固定资产清理后的净收益，固定资产余额在借方为盈利：
借：固定资产清理
贷：长期待摊费用 （属于筹建期间）
营业外收入——处理固定资产净收益 （属于生产经营期间）
7，固定资产清理后的净损失,，固定资产余额在贷方为亏损：
借：长期待摊费用 （属于筹建期间）
营业外支出——非常损失 （属于生产经营期间由于自然灾害等非正常原因造成的损失）
营业外支出——处理固定资产净损失 （属于生产经营期间正常的处理损失）
贷：固定资产清理
固定资产清理科目在处理中反应的是处置固定资产是否盈利或亏损，在处理后是没余额的。
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