山东农业大学前身是1906年创办于济南的山东高等农业学堂。后几经变迁山东农业大学研究生院，1952年经全国院系调整，山东省立农学院与当时的山东大学农学院合并山东农业大学研究生院，同时调入齐鲁大学农业专科、金陵大学园艺系、南京大学园艺系果树组，组成了新的山东农学院，校址在济南。
1958年由济南迁至泰安，1983年更名为山东农业大学。1999年7月，原山东农业大学、山东水利专科学校合并，同时山东省林业学校并入，组建新的山东农业大学。学校研究生教育始于1954年，1981年成为全国首批硕士学位授权单位，1986年开始招收博士研究生。
截至2023年2月，学校校园占地面积5340.13亩，建筑面积118.13万平方米；设有21个学院，开设90个本科专业；有在校生34546人，其中本科生28967人，博士、硕士研究生5579人，继续教育类学生23925人，教职工2531人。
截至2023年2月，学校设有21个学院，开设90个本科专业，学科专业以农业科学为优势，生命科学为特色，融农、理、工、管、经、文、法、艺术学等于一体的多科性大学。
截至2023年2月，学校有12个博士后科研流动站，12个一级学科博士点，26个一级学科硕士点、15个专业学位授权类别；2个国家重点学科，2个农业农村部重点学科，21个省级重点学科；1个省“高峰学科”，4个省“优势特色学科”。
1个省培育学科；1个省一流学科“高峰计划”建设学科，4个省一流及培育学科，农林学科连续6年入选QS世界大学学科排行榜400强，5个学科进入ESI全球排名前1%，其中植物与动物科学学科进入ESI全球排名前1‰。
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