1939年5月,国民政府教育部委托中央政治学校西宁分校筹建国立青海初级实用职业学校,将校址定在原贵德的佘乃亥。
1940年9月,国立青海初级实用职业学校建立,校址最初在青海贵德县佘乃亥,9月中旬,学校首先招收少数民族新生15名,设立预科班,开学上课。
1946年,教育部派督学黄景文视察学校。黄景文在给教育部的报告中建议迁校或解散。教育部批准迁校湟源。1946年底将一部分学生迁往湟源。开始校址未定,便借用湟源城关平民工厂的40余间房屋作临时校舍。
1947年春,继续搬迁青海畜牧兽医职业技术学院,在湟源城关西门外瓦窑子修建土木结构二层楼房1座,并修教室2间和其它一些房舍。
1949年9月,青海解放后,国立青海初级实用职业学校由湟源县人民政府接管,改名为湟源县职业学校。
1950年12月,更名为青海省湟源农牧技术学校,隶属省畜牧厅(局)、文化厅、农牧厅共同管理。
1955年5月,学校由青海省畜牧厅主管,改名为青海省湟源畜牧学校,简称湟源牧校。
1957年8月,经青海省人民委员会批准,在湟源畜牧学校北院分设青海省湟源民族畜牧校,由同一党委领导两校。学校接管湟源县牧场土地约53.3万平方米,建立巴燕实习牧场。
1958年12月,湟源民族畜牧学校又奉令并入青海省湟源畜牧学校。
“文化大革命”中,学校由青海省革委会政治部文教组主管。
1992年7月,学校复归青海省畜牧厅主管。
1984年,学校设立青海省畜牧厅成人职工中专学校。
1988年7月,干部培训部经青海省畜牧厅批准成立。
1997年,学校设立青海省畜牧职业中专。
1998年,学校被农业部确定为“全国农业职业技术教育培训示范基地”,设立农业行业特有工种技能鉴定站。
1999年,学校设立青海省湟源畜牧学校国家职业技能鉴定所。
2000年,学校被教育部确定为国家级重点中专学校。
2002年4月,经青海省人民政府批准改制为青海畜牧兽医职业技术学院,学院仍隶属省农牧厅管理。
2003年8月,学院被教育部、财政部确定为重点支持的高职院校。
2006年10月,学院在高职高专人才培养工作水平评估中被确定为“优秀”学校。
2007年,教育部、财政部批准学院成为国家重点支持“百所示范校”之一,7月,学院顺利通过教育部、财政部验收。
2011年12月,教育部新一轮人才培养工作评估学院为“通过”学校 。
2012年10月,学院成为全国11所“黄炎培优秀学校”之一。
2015年8月,学院被教育部确定为全国首批开展现代学徒制的百所试点高职院校之一。9月,以青海江河源投资集团有限公司和青海畜牧兽医职业技术学院为依托组建的青海现代农牧业职业教育集团揭牌成立。
2016年7月,学院被省教育厅、省财政重点支持建设的青海省职业教育综合能力提升示范院校。12月,学院被教育部入选“全国高校实践育人创新创业基地”。
2018年12月,学院被教育部立项建设的全国首批现代学徒制试点单位验收通过。
2020年5月,更名为青海农牧科技职业学院。
以上信息源自官网青海畜牧兽医职业技术学院,数据截止至2023年7月,请以官网为准!